Séquence répétée
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Chez l'homme, les séquences répétées représentent 50 % du génome. Dans les séquences d'ADN hautement répétitives, on distingue principalement trois types de séquences répétées :
- Séquences localisées répétées en tandem :
- ADN satellites : répété environ Modèle:Nombre, et se trouvent au niveau des Modèle:Contrad, il en existe différentes catégories.
- Séquences microsatellites : des séquences d'une à cinq paires de bases sont répétées un grand nombre de fois, répétitions longues de plusieurs kilobases (Kb), il y a plus de Modèle:Unité de répétition dans le génome.
- Séquences minisatellites : des séquences de quinze à vingt-cinq paires de bases (pb) sont répétées un grand nombre de fois (mille à deux mille fois) . Ils sont Modèle:Contrad, très polymorphes.
- Grands blocs d'ADN satellite (environ 10 % du génome humain) : blocs allant jusqu'à une dizaine de mégabases, localisés très majoritairement au niveau des centromères et télomères. Il y a des possibilités d'erreurs lors de l'ajout des séquences monotones.
- Les tranposons : constituent des séquences répétées dispersées. Ils sont répartis sur l'ensemble du génome :
- Les rétrotransposons :
- Petits éléments nucléaires intercalés (SINE) : leur taille varie entre Modèle:Nobr, les plus abondantes chez l'homme sont les séquences ALU.
- Longs éléments nucléaires intercalés (LINE) : leur taille est de quelques kilobases ou plus précisément Modèle:Unité. Ils constituent 17 % du génome humain. Les éléments LINE-1 ou L1 sont toujours actifs chez l'homme.
- Les rétrotransposons à séquences terminales longues répétées (LTR), présents en très grand nombre (~ Modèle:Unité), ils peuvent provenir de rétrovirus.
- Les transposons à ADN
- transposons à ADN : ils représentent environ Modèle:Unité et sont issus de la transposition de certains gènes d'une partie d'un chromosome, voire d'un chromosome complètement différent, vers une autre partie du génome.
- Les rétrotransposons :